講義日

• 平成22年06月10日 3--5限 13:00--18:10.
• 平成22年06月11日 3--5限 13:00--18:10.
• 平成22年06月24日 3--5限 13:00--18:10.
• 平成22年06月25日 3--5限 13:00--18:10.
• 平成22年07月01日 3--4限 13:00--16:40.

場所

• 東京大学柏図書館 ECC 端末室

講義内容

• イントロダクション
• アミノ酸配列のパターン認識
• 遺伝子発現データのパターン認識
• ネットワークを介したツールの開発

補足

• プログラミングの流れ．
• 変数．
• for 文．
• 配列１．
• if 文．
• 最大値，最小値．
• メソッド．
• 配列２．
• 文字列．

発展課題 (Advanced Exercises)

• 交差確認法 (cross-validation)
• グローバルアラインメント (global alignment)
• 局所アラインメント (local alignment)
• 隠れマルコフモデル (hidden markov model)
• 系統樹 (dendrogram)

リンク

• Java API 仕様

問い合わせ先

• 加藤毅